SD Muhammadiyah 6 Samarinda adalah "Mewujudkan Generasi Muslim yang Berilmu, Beramal, Cinta Lingkungan, Kreatif, dan Berprofil Pancasila."
Indikator Visi:
Peserta didik yang taqwa dan mengamalkan ajaran agama dalam kehidupan sehari-hari. Peserta didik yang mampu melaksanakan ibadah sesuai tuntunan Nabi. Peserta didik berprestasi akademik, lulus dengan standar maksimal, dan diterima di sekolah favorit. Peserta didik cerdas dan berprestasi di bidang akademik dan non-akademik. Peserta didik yang mandiri, percaya diri, dan kreatif. Lingkungan sekolah yang bersih, sehat, teduh, rapi, aman, dan nyaman. Visi ini menjadi panduan jangka panjang, menengah, dan pendek, serta menjiwai seluruh warga sekolah dalam mencapai tujuan yang berkelanjutan.

Mewujudkan lulusan yang beriman, bertaqwa, dan beradab Islami. Menghasilkan lulusan yang menjalankan ajaran agama sesuai Al-Quran dan As-Sunnah. Menumbuhkan karakter warga sekolah yang cerdas, disiplin, dan cinta tanah air. Mengembangkan pembelajaran yang aktif, kreatif, dan inovatif dengan memanfaatkan IPTEK. Mendorong semangat berprestasi dan kompetensi untuk menghadapi persaingan global. Menciptakan lingkungan sekolah yang sehat, bersih, hijau, dan asri.

a. Agar siswa taat beribadah sesuai dengan Al-quran dan As-Sunnah baik disekolah maupun dirumah (Kontrol Ibadah)
b. Terbentuknya sikap yang baik, sopan dan berkarakter.
c. Terwujudnya siswa berprestasi baik akademik maupun non akademik.
d. Terciptanya suasana pembelajaran aktif, inofatif, kreatif, efektif dan menyenangkan.
e. Terciptanya rasa aman dan nyaman dilingkungan sekolah.
f. Terwujudnya sikap peduli terhadap kebersihan lingkungan.
g. Terwujudnya peserta didik selalu mengamalkan nilai nilai Pancasila.
h. Terwujudnya lingkungan yang bersih, sehat, teduh, rapi, aman dan nyaman